Az interneten - mivel eltérő felépítésű hálózatokat köt össze - szükségessé vált a rajta keresztül történő kommunikáció közös szabványainak kidolgozása, amelyet az RFC (Request for Comments - leírási ajánlások) dokumentumok tartalmaznak. A szabványok közös alapjául a UNIX operációs rendszerben megvalósított megoldások szolgáltak, mivel elsőként ilyen operációs rendszerű gépeket kötöttek össze.

Az internet fontosabb alkalmazási protokolljai a következők:

• SMTP (Simple Mail Transfer Protocol): egy alkalmazási protokoll, amely a hálózati felhasználók egymással való kommunikációját teszi lehetővé; leveleket tud küldeni és fogadni.
• POP3 (Post Office Protocol): egy alkalmazásszintű protokoll, melynek segítségével az e-mail kliensek egy meglévő TCP/IP kapcsolaton keresztül letölthetik az elektronikus leveleket a kiszolgálóról. Napjainkban ez a legelterjedtebb protokoll az elektronikus levelek lekéréséhez. A jelenleg használatos harmadik változat(version 3) elődjei a POP, illetve POP2 változatok.
• TELNET: terminálemuláció segítségével - a saját gépet terminálként használva - egy távoli gépre felhasználóként lehet bejelentkezni.
• FTP (File Transfer Protocol): e fájlátviteli eljárás segítségével a felhasználó számára lehetővé teszi az általános könyvtár- és fájlműveletek végrehajtását saját gépe és egy távoli hoszt lemezegysége között (pl. fájlátvitel, -törlés, -átnevezés).
• Gopher: hierarchikusan felépített információban kereső protokoll.
• HTTP HyperText Transport Protocol: hypertext átviteli protokoll.

A következőkben ezen protokollok és az ezeket használó szolgáltatások közül a legfontosabbakat tárgyaljuk.